分子结构优化
Gaussian/ORCA;含几何优化与频率验证
Gaussian/ORCA;含几何优化与频率验证
CREST/Confab/半经验筛选+DFT复核
零点能、焓、熵、Gibbs自由能校正
ESP映射、极值点、表面电荷分布
前线轨道图、能级差、电子云分布
f+、f-、f0及局域反应性指数
电荷转移、轨道相互作用、二阶微扰能
多种电荷分布与原子贡献统计
等值面、散点图、氢键/范德华/排斥作用
Eint、BSSE校正、构型对比
SMD/PCM模型;水/有机溶剂环境
热力学循环/经验校正,适合小分子与脂质头基
TS搜索、IRC验证、活化能垒
激发态、吸收峰、跃迁贡献
频率缩放、峰归属、实验谱辅助解释
自旋密度、g值/A值辅助解释
偶极矩、极化率、静电响应
优化+TS+能垒+弱相互作用+文字解释
VASP/QE;晶格与原子位置优化
晶面切割、真空层、表面弛豫
空位、替位、间隙、异质原子掺杂
吸附构型优化与Eads计算
顶位/桥位/空位/缺陷位点对比
电荷转移可视化与差分等值面
电荷分配、电子转移定量
总态密度、分波态密度、能级解释
高对称路径、带隙、能带图
真空能级、费米能级、表面功函数
迁移路径、能垒剖面、过渡态构型
隐式溶剂、外加电场、电极表面辅助解释
层间结合、能带对齐、界面电荷转移
多步反应吸附能、自由能路径图
Li/Na/K/Zn等离子扩散与嵌入能
GROMACS/LAMMPS;拓扑、盒子、溶剂化、离子添加
OPLS/GAFF/CGenFF/CHARMM参数生成与检查
NVT/NPT,10–100 ns基础生产模拟
100–500 ns或更长采样
径向分布函数、配位数、离子/水化结构
均方位移、扩散系数D、迁移趋势
氢键数量、寿命、距离角度分布
分子接触频率、停留时间、界面亲和性
膜内外、水相/油相/界面密度剖面
Umbrella sampling/WHAM,自由能剖面
恒速拉伸、力-位移曲线、能垒估计
水-有机相/膜-溶液界面扩散过程
PoreBlazer/Zeo++/自编脚本,FVV、PSD
键合比例、残余基团、网络连通性
NEMD/压力差/化学势差驱动
MARTINI/DPD;形貌、聚集数、尺寸演化
键生成/断裂、物种演化、反应轨迹
吸附等温线、选择性、孔内分布
DFT-MD,水/电解质/界面短程演化
轨迹图+RDF/MSD/Hbond/密度/方法文字
COMSOL/Fluent;速度场、压力场、浓度场
Nernst-Planck/Poisson,电膜分离过程
ABAQUS/COMSOL;应力、应变、损伤分布
流场-电场-传热/传质耦合
通道、浓差极化、回收率和能耗估算
特征工程、模型训练、交叉验证、SHAP解释
分子图建模、材料图建模、性能预测
实验推荐、候选筛选、闭环优化
RDKit描述符、ECFP4、特征字典
SMILES清洗、描述符、预测排序、候选导出
缺失值、异常值、单位统一、字典构建
全局/局部解释、贡献图、机制讨论
能量图、轨迹快照、RDF/MSD/PDOS综合图
Methods、公式、参数表、结果解释文本
Nature/ES&T/AM风格结果描述
结构优化、频率确认、关键构型文件、能量表
Eads/Eint/ΔE计算、能量分解表、计算说明
TS结构、虚频验证、反应路径图
能垒曲线、路径构型、图表
ESP图、极值点、分子表面图
反应活性图、位点排序表
电荷表、关键原子统计、解释文字
PDOS、band structure、能级解释
ELF/EDD图、截面图、解释说明
初始结构、拓扑、平衡流程、参数说明
轨迹文件、温压能量收敛图
g(r)曲线、峰位、配位数、解释
MSD曲线、D值、线性区间说明
库仑/范德华/总相互作用能统计
时间序列、概率分布、代表构型
PMF曲线、误差估计、窗口说明
孔径分布、连通孔、自由体积分数FVV
反应键统计、交联网络、转化率表
模型文件、参数表、场分布图
网格、边界条件、速度云图
应力云图、损伤变量、模型说明
模型报告、指标、特征重要性、代码
清洗表、异常值、统一字段字典
矢量图、图注、配色建议
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